Pokrajinski registar zaštićenih prirodnih dobara se vodi u skladu sa Pravilnikom o sadržaju i načinu vođenja Registra zaštićenih prirodnih dobara („Sl. glasnik RS", br. 81/2010). Registar čine glavna knjiga i zbirka isprava i imaju status javnog dokumenta. Prema čl. 50. Zakona o zaštiti prirode, pokrajinski registar zaštićenih prirodnih dobara za teritoriju APV vodi Pokrajinski zavod za zaštitu prirode.

Pokrajinski zavod za zaštitu prirode redovn dostavlja promene podataka u pokrajinskom registru Zavodu za zaštitu prirode Srbije, u zakonskom roku od 15 dana od dana evidentiranja promene, radi upisa u centralni registar.

Poslovi vođenja Pokrajinskog registra zaštićenih prirodnih dobara za teritoriju autonomne pokrajine obavljaju se kontinuirano kroz redovno unošenje i ažuriranje podataka u papirnom i elektronom obliku kroz posebni moduo IS Zavoda. Upisivanje podataka u Pokrajinski registar vrši se na osnovu akata o stavljanju pod zaštitu, izmena ili dopuna akata o zaštiti i akata o prestanku zaštite (brisanju iz evidencije zaštićenih prirodnih dobara) i podataka iz izrađenih studija zaštite. Takođe, vrši se periodična provera podataka, kompletiranje zbirke isprava za zaštićena područja, dopunjavanje zbirke isprava izveštajima, stručnim nadzorima, aktima i podacima (arhivskim, kartografskim, katastarskim i dr.).

U AP Vojvodini pod zaštitom, sa aktom i u postupku zaštite, se trenutno nalazi 144 zaštićena područja, koja zauzimaju površinu od 225.768,57 ha odnosno 10,45% ukupne površine Vojvodine.